Me han pasado un enlace que proporciona una solución a un problema típico de Internet Explorer 6 con el position: absolute: en ocasiones los elementos con ese tipo de posicionamiento no son visibles, y si lo son en el resto de navegadores.

Si la capa con posicionamiento relativo contiene elementos flotados puede surgir el problema descrito. A los elementos posicionados absolutos habría que añadirles un clear:both; en la CSS y asunto solucionado. Si el problema persiste habría que verificar que no sea también un conflicto de z-index.

Y finalmente, el enlace: The IE6 Absolute Positioning Bug (Brett Nooyen – The CSS Asylum, enlace externo, en inglés).