Cuando se crea un sitio siempre se tiene en cuenta una resolución de pantalla mínima (generalmente 800×600 o 1024×768) a la que se verá sin que salga la molesta barra de scroll horizontal. Siempre se hace la página un poco más estrecha que dicha resolución, debido a que hay que tener en cuenta la anchura de la barra de scroll vertical.

Pero cuando la fuente del sistema es más grande de lo habitual esa barra vertical es más ancha, al menos en Internet Explorer 6, y puede salir la barra horizontal, como en este caso:

La solución parece obvia: dejar un poco más de margen para la barra de scroll vertical, haciendo que la página tenga una anchura menor.